Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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