Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TRAM2Q15035 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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