Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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