Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms