Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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