Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms