Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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