Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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