Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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