Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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