Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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