Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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