Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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