Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC173Q0VFZ6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms