Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCRN3Q0VDG4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms