Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms