Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms