Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms