Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms