Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUCB1Q02818 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms