Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ID3Q02535 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ID3Q02535 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ID3Q02535 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ID3Q02535 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ID3Q02535 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ID3Q02535 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms