Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms