Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms