Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms