Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms