Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms