Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VBP1P61758 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VBP1P61758 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms