Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCDC1P59894 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms