Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms