Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP4P57796 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms