Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP107P57740 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP107P57740 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP107P57740 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP107P57740 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms