Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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