Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDST1P52848 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDST1P52848 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDST1P52848 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDST1P52848 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms