Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DAP3P51398 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DAP3P51398 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DAP3P51398 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms