Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLK1P49759 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms