Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms