Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RECQLP46063 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RECQLP46063 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RECQLP46063 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms