Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BMI1P35226 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BMI1P35226 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms