Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP6P35125 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP6P35125 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP6P35125 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP6P35125 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms