Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL9P32969 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL9P32969 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL9P32969 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms