Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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