Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms