Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms