Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD53P19397 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD53P19397 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD53P19397 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD53P19397 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms