Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB1P14653 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB1P14653 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB1P14653 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB1P14653 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB1P14653 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB1P14653 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB1P14653 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB1P14653 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms