Protein–RNA interactions for Protein: P11717

IGF2R, Cation-independent mannose-6-phosphate receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2RP11717 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGF2RP11717 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms