Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms