Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GLI3P10071 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GLI3P10071 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GLI3P10071 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms