Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSP04118 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSP04118 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSP04118 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSP04118 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSP04118 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms