Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG7O95352 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG7O95352 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG7O95352 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms